1.什么是RIPA裂解液?
RIPA裂解液(Radio Immunoprecipitation Assay Lysis buffer,放射免疫沉淀法裂解緩沖液)是一種傳統(tǒng)的可用于裂解細(xì)胞或組織的快速裂解液,其原理為利用表面活性劑等裂解細(xì)胞膜(包括核膜),從組織或細(xì)胞中抽取可溶性蛋白。RIPA裂解液裂解后得到的蛋白一般可直接用于常規(guī)的WB、IP、co-IP等實(shí)驗(yàn)。
2.RIPA裂解液里有什么?
RIPA裂解液的配制方法有很多種,主要包括裂解成分、蛋白酶抑制劑和磷酸酶抑制劑三種組分。裂解成分可通過(guò)破壞細(xì)胞膜和蛋白間的相互作用等方式裂解組織或細(xì)胞;蛋白酶抑制劑可有效抑制各類蛋白酶的活性,避免蛋白過(guò)度降解;磷酸酶抑制劑可有效抑制去磷酸化作用。
值得注意的是,由于RIPA裂解液中含有一些穩(wěn)定性相對(duì)較弱的酶類抑制劑,故應(yīng)放在-20℃保存。其中PMSF的穩(wěn)定性極弱,半衰期只有0.5 h,所以必須現(xiàn)配現(xiàn)用。
3.如何選擇合適的RIPA裂解液?
如果您只是要做普通的WB、IP或者co-IP,我們建議您使用免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液(20118),該裂解液在裂解細(xì)胞或組織后一般不會(huì)形成粘滯的透明狀DNA團(tuán)塊,不必采用超聲處理就可進(jìn)行下一步操作。同時(shí),該裂解液還適用于磷酸化蛋白的WB檢測(cè)。
如果使用免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液(20118)的效果不是很好,那您的蛋白可能比較特殊,我們建議您可以嘗試另外幾種裂解液。如果您的蛋白是難溶性的蛋白,建議您可以嘗試使用裂解強(qiáng)度更高的裂解液,如RIPA裂解液(強(qiáng)/中);如果您在做IP實(shí)驗(yàn)的時(shí)候發(fā)現(xiàn)背景很高,即有很多非特異性蛋白被IP下來(lái),這時(shí)候您需使用裂解強(qiáng)度較強(qiáng)的裂解液,比如RIPA裂解液(強(qiáng)/中)。反之,如果您發(fā)現(xiàn)目的蛋白無(wú)法IP下來(lái),則說(shuō)明您使用的裂解液強(qiáng)度過(guò)強(qiáng),此時(shí)需使用裂解強(qiáng)度較弱的裂解液,比如RIPA裂解液(弱)。
4. RIPA裂解液適用于哪些細(xì)胞?
幾乎適用于所有實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的動(dòng)物細(xì)胞和各種組織。包括各種懸浮細(xì)胞、貼壁細(xì)胞及動(dòng)物組織等。
5. 如何判斷細(xì)胞的裂解程度?
細(xì)胞裂解:加入RIPA后,充分裂解的細(xì)胞,沒(méi)有細(xì)胞沉淀,很粘稠。如果像渾濁的水一樣粘性很小則可能是裂解液得量加太多導(dǎo)致的;相反,如果RIPA裂解液后出現(xiàn)膠狀物體,離心不能沉淀則可能是蛋白太多,RIPA裂解液加入的量太少導(dǎo)致的。
組織裂解:先將組織剪成細(xì)小的碎片,之后利用勻漿器或超聲破碎的方法,鏡檢顯示細(xì)胞破碎率大于90%,同時(shí)組織已經(jīng)wan全裂解,沒(méi)有明顯的小組織塊。之后按照細(xì)胞裂解的步驟進(jìn)行裂解,裂解程度的判斷標(biāo)準(zhǔn)與細(xì)胞裂解一致。
RIPA裂解液的裂解產(chǎn)物中經(jīng)常會(huì)出現(xiàn)一小團(tuán)透明膠狀物,該透明膠狀物為含有基因組DNA等的復(fù)合物。在不檢測(cè)和基因組DNA結(jié)合特別緊密的蛋白的情況下,可以直接離心取上清進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn);如果需要檢測(cè)和基因組結(jié)合特別緊密的蛋白,則需通過(guò)超聲處理打碎打散該透明膠狀物,隨后離心取上清用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。如果檢測(cè)一些常見(jiàn)的轉(zhuǎn)錄因子,如NF-κB、p53等時(shí),通常不必進(jìn)行超聲處理,就可以檢測(cè)到這些轉(zhuǎn)錄因子。
6. RIPA儲(chǔ)存出現(xiàn)白色沉淀,為什么?
一般是由于裂解液中SDS在儲(chǔ)存的時(shí)候沉淀析出導(dǎo)致,這時(shí)只需將裂解液放置于37℃水浴加熱后恢復(fù)室溫即可使用。
7. RIPA裂解液可以獲得細(xì)胞中的不同蛋白嗎?
RIPA裂解液提取的是全蛋白,包括核蛋白、漿蛋白、膜蛋白等。如果要提取特定的蛋白(如:核蛋白、膜蛋白)則可利用專門提這類蛋白的試劑盒進(jìn)行提取。
遠(yuǎn)慕在這里給出的建議僅供大家參考,具體裂解液的選擇和使用,還需要根據(jù)您自己的實(shí)驗(yàn)需求和實(shí)驗(yàn)效果選擇適合您實(shí)驗(yàn)的RIPA裂解液。
8.RIPA裂解液的使用方法
如發(fā)現(xiàn)RIPA有沉淀,請(qǐng)放室溫半小時(shí)或者常溫水浴使沉淀溶解。
根據(jù)使用量,取每1ml RIPA 加入10ul PMSF,使PMSF的最終濃度為1mM。混勻備用 (PMSF現(xiàn)用現(xiàn)加)。
1.樣品前處理:
a)對(duì)于貼壁細(xì)胞:去除培養(yǎng)液,用 PBS、生理鹽水或無(wú)血清培養(yǎng)液洗一遍。按照 6 孔板每孔細(xì)胞量加入150-250 ul裂解液的比例加入裂解液。用槍吹打數(shù)下,使裂解液和細(xì)胞充分接觸。
b)對(duì)于懸浮細(xì)胞:離心收集細(xì)胞,用手指把細(xì)胞用力彈散。按照 6 孔板每孔細(xì)胞量加入 150-250 ul 裂解液的比例加入裂解液,再用手指輕彈以充分裂解細(xì)胞。充分裂解后應(yīng)沒(méi)有明顯的細(xì)胞沉淀。如果細(xì)胞量較多,必需分裝成50-100萬(wàn)細(xì)胞/管,然后再裂解。
c)對(duì)于組織樣品: 把組織剪切成細(xì)小的碎片。按照每20mg組織加入150-250 ul裂解液的比例加入裂解液。 (如果裂解不充分可以適當(dāng)添加更多的裂解液,如果需要高濃度的蛋白樣品,可以適當(dāng)減少裂解液的用量)。用玻璃勻漿器勻漿,直至充分裂解。
2.后處理:
將裂解后的樣品10000-14000g離心3-5分鐘,取上清,即可進(jìn)行后續(xù)的PAGE、Western和免疫沉淀等操作。
注意事項(xiàng) :
強(qiáng)烈型裂解液,可以提取核蛋白,但在提取核蛋白的同時(shí),也會(huì)將基因組一并釋放出來(lái),造成細(xì)胞裂解液粘稠,此時(shí)可以直接加入蛋白上樣緩沖液,煮沸再離心,離心后直接上樣電泳;若想測(cè)定濃度,可入加少量 SDS(1%),煮沸后離心測(cè)濃度。本系列蛋白提取試劑所提取的蛋白由于含有去污劑,所以不適合使用Bradford蛋白濃度測(cè)定試劑盒,請(qǐng)選擇BCA法或者Lowry法檢測(cè)蛋白濃度。